A Daikin Online Controller nem telepíthető többegységes belső rendszerekre. Több egységes belső rendszerek esetén a beltéri egységek nem működtethetők inkompatibilis működési módokban (pl. egyszerre hűtés és fűtés). Az üzemmódok módosításakor az elsődleges egység prioritást élvez (további részletekért lásd a belső egység kézikönyvét). Ha az elsődleges egységen kiválasztott üzemmóddal inkompatibilis működési módban vannak, az elsőbbséggel nem rendelkező egységek készenléti üzemmódba lépnek.
